Un poco de TIC a escala molecular y con impacto enorme.
        LuiGi

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>Hacia la ferretería para células
>Un grupo español entra en el concurso del MIT
>que fomenta la biología sintética
>IGNACIO ZAFRA - Valencia
>EL PAÍS - 05-07-2006
>
>Los críticos sostienen que la comparación con la electrónica
>no es válida. La sistematización, la creación de un registro
>y la producción en cadena son claves.
>Un equipo de 12 estudiantes, tres doctores y cuatro profesores
>de dos universidades trabaja estos días a contrarreloj en
>Valencia para preparar su participación en el concurso iGEM 2006,
>organizado por el prestigioso Instituto Tecnológico de
>Massachusetts, el MIT. La competición, a la que concurren 40
>grupos, gira en torno a la biología sintética, una rama de la
>ciencia tan nueva que carece de una definición consolidada.
>
>Una de las posibles definiciones la describe como un campo de
>investigación que combina los métodos de la ingeniería y de la
>biología para introducir nuevos circuitos biológicos, compuestos
>por proteínas y ácidos nucleicos, en células, mediante un proceso
>de estandarización análogo al utilizado en la electrónica.
>Toscamente, podría decirse que pretende programar
>microorganismos, especialmente bacterias, para que cumplan tareas
>que no realizarían de modo natural. Y hacer esa programación de
>tal forma (ordenada, sistemática y con carácter predictivo) que
>cada nuevo circuito (cada parte o bioladrillo, en su terminología),
>quede fijado definitivamente en un registro. De modo que, en el
>futuro, cualquiera pueda reaprovecharlo con la misma tranquilidad
>con la que hoy se acude a una ferretería y se pide un tornillo
>del seis.
>
>Algunas de las aplicaciones futuras que se atribuyen a la biología
>sintética parecen ciencia ficción. Y sus defensores dibujan un área
>de aplicaciones prácticamente ilimitada: la fabricación de
>medicamentos a gran escala, la producción de energía limpia (como
>el hidrógeno) y la detección de explosivos o de agentes tóxicos en
>lugares de difícil acceso (bajo tierra o dentro del cuerpo humano),
>por poner tres ejemplos.
>
>La disciplina es muy joven y recibe importantes críticas. Una de
>ellas señala que la idea puede ser interesante, pero que el
>contexto biológico es muy complejo, y que la comparación con la
>electrónica no es válida porque las moléculas no se comportan
>como componentes electrónicos.
>
>Quizá por ello los cuatro profesores de las universidades de
>Valencia y Politécnica de Valencia -Pedro Fernández de Córdoba,
>Jesús Salgado, Albert Ferrando y Javier Urchueguía- se expresan
>con cautela, utilizan constantemente la locución "en principio"
>y repiten una frase: "La biología sintética no ha inventado nada",
>ya que se ha dedicado a recoger los frutos de los trabajos
>realizados en las últimas décadas en los terrenos de la ingeniería
>genética, la ingeniería molecular y la biología de sistemas.
>Y todavía más: "La biología sintética, tal y como está concebida
>hoy, no pretende crear células. Una célula consta de miles de
>funciones programadas por su propio genoma, y no es realista
>pensar en hacer eso ahora".
>
>La cuestión, por un lado, reside en programar microorganismos,
>principalmente bacterias y levaduras, mediante la introducción
>en ellas de moléculas de ADN. Un trabajo que en parte ya se
>realiza a diario en laboratorios de investigación biológica y en
>empresas de biomedicina y biotecnología. En este caso se trata de
>utilizar las partes o ladrillos para crear circuitos. Algunos,
>como los promotores, tienen encomendada la tarea de poner en
>marcha la expresión de otros genes ante unas condiciones
>determinadas; otros, llamados reporters, deben en teoría emitir
>una señal (como la fluorescencia) si el circuito funciona, y
>hacerlo con una gradación que permita cuantificar (por ejemplo,
>la proporción de cafeína en un medio líquido).
>
>La gran novedad proviene de un cambio de perspectiva y de la
>interiorización de un concepto: la estandarización, a través del
>registro de cada parte o ladrillo con características y funciones
>definidas. El cambio de perspectiva consiste en mirar el asunto
>desde los ojos de un ingeniero. Para fabricar un avión, señalan,
>no es necesario que los constructores conozcan desde la raíz el
>funcionamiento de todos los componentes. Les basta con saber dónde
>va y para qué sirve cada una de las piezas. Del mismo modo, los
>biólogos sintéticos no tratan de averiguar el mecanismo exacto que
>rige un proceso molecular. Se esfuerzan, en cambio, por conseguir
>que el circuito biológico funcione, y en comprobar que ese éxito
>sea trasladable a otros contextos celulares. Volviendo al símil
>de la electrónica: "Una parte de un circuito (una resistencia o
>un condensador), puede utilizarse indistintamente para fabricar
>un televisor, una radio o un [sistema de control de vehículos]
>ABS".
>
>La voluntad de sistematización, de creación de un gran registro
>de partes y de producción en cadena -que hace entrever un mareante
>potencial comercial- los distingue de los biólogos convencionales,
>más empíricos.
>
>En la nueva disciplina es fundamental el método, para el que
>resulta muy importante la modelización matemática por ordenador.
>El método está definido por el enfoque multidisciplinar de la
>biología sintética, que encarnan perfectamente los profesores
>del grupo valenciano, el único español que competirá en iGEM
>contra los equipos de las universidades de Princeton, Harvard,
>Caltech, Berkeley, Cambridge, el Imperial College de Londres y
>el ETH de Zurich, entre otros, además del propio MIT.
>
>El concurso, donde los protagonistas son los estudiantes, nació
>en 2004 y entonces compitieron sólo cinco grupos, los de los
>gigantes universitarios de EE UU. Los resultados de algunos
>equipos se han publicado en la revista Nature.
>
>Alrededor de una mesa de la sala de juntas de la Escuela de
>Ingenieros Industriales de Valencia se sientan los profesores
>Fernández de Córdoba (doctor en física y en matemáticas),
>Salgado (bioquímico, doctor en química), Ferrando (doctor en
>física y especialista en fotónica) y Urchueguía (doctor en
>física y especialista en energía). Son los coordinadores del
>grupo junto al profesor Alfonso Jaramillo, de la École
>Polytechnique de París.
>
>El valor de iGEM no proviene de producir grandes descubrimientos,
>aseguran, sino de fomentar que los estudiantes de último año
>desarrollen su carrera en biología sintética, un campo tan nuevo
>que todavía no dispone de suficiente masa crítica. El equipo de
>Valencia empezó a trabajar en febrero, pero acaba de empezar a
>definir su proyecto, que deberá estar listo en septiembre. Los
>primeros meses los dedicaron a aprender. "Hacen falta matemáticas,
>a las que los biólogos no están tan acostumbrados, pero los
>físicos sí. Y hace falta algo de experiencia en un laboratorio
>biológico, algo que los físicos no conocen". Siendo realistas,
>el objetivo no es ganar el concurso. Ni siquiera es básico que
>el proyecto funcione en la práctica. Lo importante es "cubrir el
>mayor número de etapas posibles: diseñar el proyecto, modelizarlo,
>simularlo e implementarlo. Y luego, a ser posible, que funcione",
>explican.
>
>Con el tiempo del que disponen, no van a tratar de generar sus
>propios ladrillos, sino de crear un circuito usando algunas de
>las partes ya contrastadas que el propio MIT proporciona a los
>que participan. No hay que olvidar, recuerdan, que uno de los
>objetivos de la biología sintética es "aprovechar el conocimiento
>que ya existe para buscar una estandarización que permita un
>desarrollo distinto".
>
>Uno de los proyectos por los que se inclina el equipo consiste
>en la "implementación de un circuito molecular o genético en una
>bacteria para que ésta detecte una sustancia química
>predeterminada. Y que ello implique la síntesis de una proteína
>reporter fluorescente, medible con suficiente sensibilidad".
Nearby Wed Jul 5 10:58:49 2006